Η Κίρκη είναι περισσότερο γνωστή ως μάγισσα ή ως Νύμφη. Θεωρούνταν όμως και δευτερεύουσα θεότητα. Πατέρας της ήταν ο θεός Ήλιος και μητέρα της ήταν η Πέρση, μια από τις Ωκεανίδες. Ήταν επίσης αδελφή του Αιήτη και της Πασιφάης.
Η Κίρκη ζούσε στο νησί στο οποίο ήταν βασίλισσα, την Αίαια, και μεταμόρφωνε τους εχθρούς της ή όσους την προσέβαλαν, σε ζώα, με τη χρήση μαγικών ποτών, καθώς γνώριζε πολλά για τα βότανα και τη φαρμακευτική τους επίδραση. Αναφέρεται σε αρχαία παράδοση ότι εξάγνισε τους Αργοναύτες για τον θάνατο του Αψύρτου.
Έγινε ευρέως γνωστή μέσα από την Οδύσσεια του Ομήρου όπου περιγράφεται να ζει σε ένα τεράστιο μέγαρο στη μέση ενός ξέφωτου όπου εκεί ύφαινε στον αργαλειό. Ο ίδιος ο Οδυσσέας φαίνεται να έχει αναφέρει πως τριγύρω υπήρχαν λιοντάρια και λύκοι όπου τα είχε πλανέψει με τη μαγεία της. Εκεί έφτασε ο Οδυσσέας με τους συντρόφους του χωρίς να φαίνεται να είναι απειλή για τα άγρια ζώα.
Τους πρώτους από αυτούς που την επισκέφθηκαν η Κίρκη προσκάλεσε σε γεύμα με φαγητά στα οποία είχε ρίξει κάποιο από τα μαγικά της φίλτρα. Μετά το φαγητό, τους άγγιξε με το μαγικό της ραβδάκι και τους μεταμόρφωσε σε χοίρους. Μόνο ο Ευρύλοχος, που την υποψιάσθηκε από την αρχή, γλίτωσε και ειδοποίησε τον Οδυσσέα και τους άλλους που είχαν μείνει στα πλοία τους. Ο Οδυσσέας ξεκίνησε να σώσει τα θύματα της Κίρκης. Στο δρόμο τον πρόλαβε ο Ερμής και του είπε να προμηθευθεί το βοτάνι μώλυ για να μην έχει την ίδια τύχη. Αφού τα μαγικά της Κίρκης απέτυχαν, η μάγισσα εξεπλάγη τόσο ώστε να ερωτευθεί τον Οδυσσέα και να συμφωνήσει να ξαναδώσει στους συντρόφους του την ανθρώπινη μορφή. Στη συνέχεια ο Οδυσσέας και οι σύντροφοί του παρέμειναν στο νησί της επί ένα έτος και μετά τους έδωσε οδηγίες πώς να επιστρέψουν στην πατρίδα τους, περιγράφοντάς τους δύο διαφορετικές πορείες.
Εκείνη τους προειδοποίησε ότι θα αντιμετώπιζαν πολλούς κινδύνους στο ταξίδι τους. Συγκεκριμένα τους είπε να μην πειράξουν τις αγελάδες του θεού Ήλιου, που βρίσκονταν στο νησί της Θρινακίας. Τελικά ο Οδυσσέας ήταν ο μόνος αποφασισμένος να τηρήσει αυτή την συμβουλή, γι’ αυτό και ήταν ο μόνος από τα μέλη του πληρώματος που ολοκλήρωσε το ταξίδι της επιστροφής.
Σε μια νεώτερη έκδοση του μύθου της Κίρκης, ο Οδυσσέας έκανε μαζί της ένα γιο τον Τηλέγονο, ο οποίος όταν μεγάλωσε αναζήτησε τον πατέρα του. Έφτασε στην Ιθάκη και χωρίς να ξέρει πού βρισκόταν έκανε επιδρομή στο νησί. Ο Οδυσσέας έτρεξε να τον απωθήσει και στη μάχη που ακολούθησε ο Τηλέγονος τον σκότωσε, χωρίς να γνωρίζει ότι ήταν ο πατέρας του. Το γεγονός αυτό πραγματοποίησε μια προφητεία που έλεγε ότι ο θάνατος του Οδυσσέα θα ερχόταν από τη θάλασσα. Ο Τηλέγονος τότε παντρεύτηκε την Πηνελόπη. Οι δυο τους μαζί με τον ετεροθαλή αδερφό του τον Τηλέμαχο ταξίδεψαν στο νησί της Κίρκης, όπου ο Τηλέμαχος παντρεύτηκε την Κίρκη. Τότε εκείνη χάρισε την αθανασία και στους τρεις.